진화적 변화와 개체군 역학
생물 다양성과 농업 외에도, aeDNA는 열대 및 아열대 생태계의 진화적 변화와 개체군 역학을 밝혀줍니다. 습식 및 건식 실험실 기술의 발전으로 aeDNA 기반의 개체군 수준 분석이 점차 가능해지고 있습니다. 아프리카에서 수행된 초기 aeDNA 연구 중 일부는 환경 변화가 개체군 유전에 미치는 영향을 평가했습니다. 19세기부터 20세기까지 케냐 나이바샤 호수에서 짧고 변이가 심한 마커를 사용하여 규조류 개체군을 조사했습니다[ 64 ]. 현미경 분석에서는 단일 Navicula 종(길쭉한 규조류)의 존재가 확인되었지만, aeDNA 분석 결과는 부영양화와 관련된 Navicula 하플로타입 의 급격한 변화에 대한 증거를 제시했습니다 . 윤충류(작은 동물플랑크톤)에 대한 또 다른 단일 마커 연구에서는 케냐 수구타 계곡의 카게냐 호수에서 하플로타입 변화와 건조 기후에서 습윤 기후로의 변화 사이에 강한 연관성이 있음을 발견했습니다[ 29 ]. 멕시코 퇴적물에서 얻은 aeDNA의 샷건 시퀀싱을 통해 검은곰( Ursus americanus )과 멸종된 거대 짧은얼굴곰( Arctodus simus ) 의 저해상도 게놈을 재구성할 수 있었습니다 [ 65 ]. 결과는 후기 플라이스토세 멕시코 검은곰이 오늘날 동부 아메리카 개체군과 관련이 있음을 보여주었습니다. 또한 이 발견은 멕시코와 베링 짧은얼굴곰 개체군 사이에 깊은 분화가 있음을 확인했습니다.
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