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제목
부위별 동역학
등록일
2026.05.15
부위별 동역학의 변화를 분석하기 위해, 단백질 단독 및 단백질-DNA 복합체 모두에서 Cu(I)의 함수로 CW-ESR 스펙트럼을 기록했습니다. 예를 들어, E. coli CueR의 A16R1 돌연변이체의 스펙트럼은 그림 8 에 나타냈습니다 . 선형 변화는 EasySpin( 73 , 84 , 85 ) 에 구현된 MOMD 모델을 사용하여 스펙트럼을 시뮬레이션함으로써 정량화했습니다 . MOMD 모델은 니트로옥사이드 스핀 라벨의 움직임에 대한 공간적 질서화 포텐셜에 기반합니다. 모델에 CW-ESR 스펙트럼을 피팅할 때, 최적의 피팅이 이루어질 때까지 스핀 라벨 움직임의 회전 상관 시간(τcorr ) 과 질서 매개변수를 체계적으로 변화시켰습니다. 부위별 동역학이 증가하면 질서 매개변수가 감소하거나 τcorr이 증가합니다 ( 107 ) . 이 연구에서 검출된 단백질 측쇄의 상관 시간은 몇 나노초 정도이며 이는 일반적으로 전체 단백질의 전체 회전 속도보다 낮습니다( 110 ).


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